Появились новые данные о генетике белков плазмы крови
1 ноября 2023Учёные выявили тысячи генетических вариантов, влияющих на белки плазмы крови, большинство из которых ранее не были описаны. Анализ почти 3 000 белков, циркулирующих в плазме крови, позволил обнаружить примерно в 20 раз больше генетических ассоциаций, чем все предыдущие исследования, посвящённые изучению антител. Благодаря данной работе учёные получили более точное представление о том, как генетические особенности влияют на белки плазмы крови и развитие определённых заболеваний, что, безусловно, будет способствовать открытию новых терапевтических мишеней и препаратов. Исследование опубликовано в журнале Nature.
«Данная работа открывает биомедицинскому сообществу совершенно новые направления. Это исследование – яркий пример того, как междисциплинарное сотрудничество даёт возможность получить значимые результаты. Теперь учёные смогут использовать новые данные для исследования этиопатогенеза множества заболеваний и, возможно, разработают эффективные методы лечения», – сказала Наоми Аллен (Naomi Allen), PhD, старший научный сотрудник Британского биобанка.
Крупномасштабное демографическое протеогеномное исследование позволило выявить более 12 000 локусов количественных признаков (pQTL), которые представляют собой независимые ассоциации между генетическими вариантами и концентрацией определённых белков плазмы крови. Эта работа стала возможной благодаря Британскому биобанку, который содержит генетические и фенотипические данные 500 000 добровольцев, набранных в период с 2006 по 2010 годы. Открытый доступ, подробные фенотипические характеристики и постоянное развитие биобанка создают уникальные возможности для расширения исследований, а использование высокопроизводительных технологий позволяет ускорить открытие биомаркеров, улучшить диагностику и лечение заболеваний.
Благодаря данному исследованию был создан проект Pharma Proteomics Project («Фармацевтическая протеомика»), объединивший 13 ведущих биофармацевтических компаний, цель которого разработать крупнейший в мире протеомный атлас.
Учёные охарактеризовали протеомные профили плазмы крови 54 219 участников. Команда исследователей под руководством Бенджамина Б. Сана (Benjamin B Sun), PhD, научного сотрудника Кембриджской компании Biogen в штате Массачусетс (Biogen in Cambridge, Massachusetts), проанализировала концентрацию 2 923 белков, связанных с кардиометаболизмом, неврологическими и онкологическими заболеваниями, а также воспалительными процессами, в плазме крови 2 941 человека.
Дальнейшее комплексное картирование локусов количественных признаков позволило выявить 14 287 генетических ассоциаций, 81% из которых не были описаны ранее. Полученные данные сформировали новое представление о trans-pQTLs многих биологических доменов и молекулярных путях, связанных с цитокинами и системой комплемента. Также было описано влияние генов на лиганд-рецепторные взаимодействия.
В первой статье основное внимание уделяется протеогеномным эффектам редких мутаций и совокупному взаимодействию популяционных вариантов. Другая публикация посвящена сравнению данных, полученных при анализе двух крупных когорт, и дальнейшим перспективам исследования.
«На сегодняшний день в генетические исследования вложены значительные средства, и это способствует развитию прецизионной медицины. Однако, для того чтобы вовремя подобрать эффективный препарат для конкретного пациента, необходимо выходить за рамки генетических тестов. Данные, полученные в ходе исследования, дали возможность увидеть более полную картину того, как гены и белки могут влиять на состояние человека. Необходимо продолжить изучение биологических ассоциаций и определить мишени для воздействия лекарственных средств, что позволит улучшить диагностическую эффективность анализа крови», – сказал Крис Уилан (Chris Whelan), PhD, директор направления нейробиологии компании Johnson&Johnson, глава проекта «Pharma Proteomics Project».
Сводные статистические данные исследования доступны на портале AZPheWAS.com.
