НИПТ показал высокую точность обнаружения распространённых трисомий

В ходе нового исследования учёные доказали, что неинвазивный пренатальный тест (НИПТ) очень точен в выявлении распространённых трисомий при беременности с общепопуляционным риском. Результаты этой работы станут основой новых клинических рекомендаций Американского колледжа медицинской генетики и геномики (The American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG).

НИПТ, анализирующий внеклеточную ДНК в крови будущих матерей, начали применять около десяти лет назад для выявления анеуплоидий у плода. Лаборатории с помощью этого теста не только проводили скрининг трисомий 13, 18 и 21 хромосом среди одноплодных беременностей, но и адаптировали его для обнаружения редких трисомий и микрохромосомных аномалий, а также использовали при многоплодной беременности.

«Неинвазивный пренатальный тест является общепринятым методом антенатального скрининга на анеуплоидию. Однако большинство первоначальных исследований эффективности были проведены в популяциях высокого риска, и до настоящего времени не существовало систематических обзоров с доказательствами эффективности его использования при беременностях с общепопуляционным риском», — пояснила соавтор исследования Нэнси Роуз (Nancy Rose) из Университета штата Юта (University of Utah). «Кроме того, существует большое количество заболеваний, которые могут быть обнаружены благодаря НИПТ, при этом некоторые из них не выявляются с помощью традиционного комбинированного пренатального скрининга».

Для решения этой проблемы Роуз вместе с коллегами из рабочей группы ACMG оценили данные, подтверждающие использование НИПТ в группе беременных с общепопуляционным риском. В статье, опубликованной в журнале Genetics in Medicine, они описали результаты анализа почти 90 исследований и продемонстрировали, что НИПТ высокоточен при обнаружении трисомий 13, 18 и 21 хромосом как при одноплодной, так и при многоплодной беременности. Однако эффективность этого теста отличается для других патологий.

Группа учёных ACMG изучила литературу и выявила 87 исследований, в которых анализировалось использование НИПТ для выявления трисомий и других патологий. Обзор научных работ показал, что для трёх наиболее распространённых трисомий НИПТ демонстрирует высокую эффективность. Для трисомии 21 хромосомы (было проведено 35 различных исследований) НИПТ имел чувствительность 98,80%, специфичность 99,96%, положительное прогностическое значение (PPV) 91,78% и точность 99,94%.

Для трисомии 18 или 13 хромосом было проведено меньше исследований. Тем не менее они также имели высокую чувствительность, специфичность и точность. Но при этом у них был ниже показатель PPV — 65,77% и 37,23% соответственно. Для всех трёх трисомий НИПТ имел низкий уровень ложноположительных результатов: от 0,04% для трисомии 21 и 13 хромосом, до 0,07% для трисомии 18 хромосомы. Полученные данные позволяют предположить, что НИПТ является высокоточным методом скрининга распространённых трисомий.

Несмотря на то, что информации по многоплодным беременностям было немного, группа обнаружила, что диагностическая эффективность НИПТ для выявления распространённых трисомий в этих случаях также была высокой.

НИПТ продемонстрировал точность и для анеуплоидий половых хромосом, но он имела более изменчивую эффективность при обнаружении редких аутосомных трисомий и микрохромосомных аномалий (copy number variation, CNV). Для CNV производительность зависит от размера CNV: три исследования показали, что НИПТ может обнаруживать CNV размером больше 5 Мб с чувствительностью более 90%, а меньшие CNV – только 68,42%.

Авторы предупредили, что даже при доказанной высокой точности скрининга трисомий 21, 18 и 13 хромосом НИПТ является лишь скрининговым тестом, и положительный результат должен сопровождаться диагностическим исследованием. Также было показано, что, несмотря на уменьшение количества инвазивных диагностических процедур с появлением НИПТ, большинство людей, получивших результат с высоким риском, не отказываются от подобного тестирования.

Учёные уверены, что полученные данные послужат основой для будущих рекомендаций ACMG. По словам Дженнифер Малиновски (Jennifer Malinowski), старшего методиста ACMG, документ находится на завершающей стадии подготовки, а окончательный вариант ожидается осенью.