Полногеномное секвенирование позволило выявить новый генетический маркер риска развития кардиомиопатии

В новом исследовании, опубликованном в журнале eBioMedicine, описаны генетические причины кардиомиопатии. От этого заболевания страдает один из 500 человек: у пациентов изменяется структура и функции сердца, что может привести к сердечной недостаточности.

Исследование показало, что у людей с кардиомиопатией тандемные повторы обнаруживаются чаще, и они могут быть причиной 4% случаев заболевания (известно, что экспансия тандемных повторов провоцирует развитие более 60 генетических патологий).

«Ранее не было информации о влиянии экспансии тандемных повторов на возникновение кардиомиопатии. После проведённого исследования появился ещё один критерий отбора пациентов с высоким риском развития данного заболевания, это поможет врачам быстрее устанавливать верный диагноз», – говорит руководитель исследования доктор Райен Юэн (Dr. Ryan Yuen), старший научный сотрудник Программы геномной биологии Детского госпиталя SickKids (Genetics & Genome Biology program).

Учёные выявили корреляцию экспансии тандемных повторов в гене DIP2B с высоким риском развития кардиомиопатии. Определение точного местоположения тандемных повторов поможет при разработке новых методов терапии в рамках проекта Детского госпиталя SickKids Precision Child Health, направленного на формирование индивидуального подхода к лечению пациентов.

«Знания о генетике заболеваний позволяют сделать методы лечения более точными. Такой подход работает в отношении многих наследственных заболеваний, в том числе и кардиомиопатии», – говорит руководитель исследования доктор Сима Митал (Dr. Seema Mital), старший научный сотрудник Программы геномной биологии (Genetics & Genome Biology program), кардиолог отделения кардиологии (Division of Cardiology) и руководитель направления сердечно-сосудистых исследований Детского госпиталя SickKids (Cardiovascular Research at SickKids).

Команда исследовала геномы 1 200 человек с кардиомиопатией, а также представителей контрольной группы. Оказалось, что у детей, родители которых страдают кардиомиопатией, экспансия тандемных повторов шире – этот феномен известен как «генетическое ожидание». В таких случаях возрастает вероятность того, что функция гена будет нарушена. Более крупные тандемные повторы также могут являться причиной раннего начала заболевания и более выраженных симптомов. В связи с этим учёные пытаются разработать метод остановки расширения тандемных повторов.

«Нашей конечной целью является создание метода остановки расширения тандемных повторов, что должно улучшить результаты лечения пациентов. Понимание механизма, лежащего в основе экспансии тандемных повторов, даёт возможность найти способ снижения их воздействия», – говорит Юэн.

Новые вычислительные методы, разработанные в лаборатории доктора Юэн (Yuen's lab) совместно с Центром прикладной геномики Детского госпиталя SickKids (Center for Applied Genomics at SickKids), позволили команде определить местоположение и размеры тандемных повторов в геноме человека.

«С помощью полногеномного секвенирования мы можем проанализировать тандемные повторы по всему геному, так мы получим более полную картину генетической предрасположенности к развитию кардиомиопатии», – говорит ведущий автор исследования доктор Александра Митина (Dr. Aleksandra Mitina), научный сотрудник лаборатории доктора Юэн.

Новая технология позволит изучить влияние тандемных повторов на развитие других наследственных патологий и разработать методы лечения.

Источник: https://medicalxpress.com/news/2024-02-genome-sequencing-reveals-genetic-marker.html